International Tables for Crystallography (2006). Vol. F, ch. 21.1, pp. 497-506   | 1 | 2 |
doi: 10.1107/97809553602060000707

Chapter 21.1. Validation of protein crystal structures

Contents

  • 21.1. Validation of protein crystal structures  (pp. 497-506) | html | pdf | chapter contents |
    • 21.1.1. Introduction  (p. 497) | html | pdf |
    • 21.1.2. Types of error  (pp. 497-498) | html | pdf |
    • 21.1.3. Detecting outliers  (pp. 498-499) | html | pdf |
      • 21.1.3.1. Classes of quality indicators  (p. 498) | html | pdf |
      • 21.1.3.2. Local statistics  (pp. 498-499) | html | pdf |
      • 21.1.3.3. Global statistics  (p. 499) | html | pdf |
    • 21.1.4. Fixing errors  (p. 499) | html | pdf |
    • 21.1.5. Preventing errors  (pp. 499-500) | html | pdf |
    • 21.1.6. Final model  (p. 500) | html | pdf |
    • 21.1.7. A compendium of quality criteria  (pp. 500-505) | html | pdf |
      • 21.1.7.1. Data quality  (pp. 500-501) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.1. Merging R values  (pp. 500-501) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.2. Completeness  (p. 501) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.3. Redundancy  (p. 501) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.4. Signal strength  (p. 501) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.5. Resolution  (p. 501) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.6. Unit-cell parameters  (p. 501) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.7. Symmetry  (p. 501) | html | pdf |
      • 21.1.7.2. Model quality, coordinates  (pp. 501-504) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.1. Geometry and stereochemistry  (pp. 501-502) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.2. Torsion angles (dihedrals)  (pp. 502-503) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.3. C α -only models  (p. 503) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.4. Contacts and environments  (p. 503) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.5. Noncrystallographic symmetry  (p. 503) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.6. Solvent molecules  (p. 503) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.7. Miscellaneous  (pp. 503-504) | html | pdf |
      • 21.1.7.3. Model quality, temperature factors  (p. 504) | html | pdf |
      • 21.1.7.4. Model versus experimental data  (pp. 504-505) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.1. R values  (pp. 504-505) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.2. Real-space fits  (p. 505) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.3. Coordinate error estimates  (p. 505) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.4. Noncrystallographic symmetry  (p. 505) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.5. Difference density quality  (p. 505) | html | pdf |
      • 21.1.7.5. Accountancy  (p. 505) | html | pdf |
    • 21.1.8. Future  (p. 506) | html | pdf |
    • References | html | pdf |