International Tables for Crystallography (2012). Vol. F, ch. 21.1, pp. 649-661   | 1 | 2 |
doi: 10.1107/97809553602060000879

Chapter 21.1. Validation of protein crystal structures

Contents

  • 21.1. Validation of protein crystal structures  (pp. 649-661) | html | pdf | chapter contents |
    • 21.1.1. Introduction  (p. 649) | html | pdf |
    • 21.1.2. Types of error  (pp. 649-650) | html | pdf |
    • 21.1.3. Detecting outliers  (pp. 650-651) | html | pdf |
      • 21.1.3.1. Classes of quality indicators  (p. 650) | html | pdf |
      • 21.1.3.2. Local statistics  (pp. 650-651) | html | pdf |
      • 21.1.3.3. Global statistics  (p. 651) | html | pdf |
    • 21.1.4. Fixing errors  (pp. 651-652) | html | pdf |
    • 21.1.5. Preventing errors  (p. 652) | html | pdf |
    • 21.1.6. Final model  (p. 652) | html | pdf |
    • 21.1.7. A compendium of quality criteria  (pp. 652-658) | html | pdf |
      • 21.1.7.1. Data quality  (pp. 653-654) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.1. Merging R values  (p. 653) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.2. Completeness  (p. 653) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.3. Redundancy  (p. 653) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.4. Signal strength  (p. 653) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.5. Resolution  (p. 653) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.6. Unit-cell parameters  (pp. 653-654) | html | pdf |
        • 21.1.7.1.7. Symmetry  (p. 654) | html | pdf |
      • 21.1.7.2. Model quality, coordinates  (pp. 654-656) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.1. Geometry and stereochemistry  (p. 654) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.2. Torsion angles (dihedrals)  (pp. 654-655) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.3. C α -only models  (p. 655) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.4. Contacts and environments  (pp. 655-656) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.5. Noncrystallographic symmetry  (p. 656) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.6. Solvent molecules  (p. 656) | html | pdf |
        • 21.1.7.2.7. Miscellaneous  (p. 656) | html | pdf |
      • 21.1.7.3. Model quality, temperature factors  (pp. 656-657) | html | pdf |
      • 21.1.7.4. Model versus experimental data  (pp. 657-658) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.1. R values  (p. 657) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.2. Real-space fits  (p. 657) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.3. Coordinate error estimates  (pp. 657-658) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.4. Noncrystallographic symmetry  (p. 658) | html | pdf |
        • 21.1.7.4.5. Difference density quality  (p. 658) | html | pdf |
      • 21.1.7.5. Accountancy  (p. 658) | html | pdf |
    • 21.1.8. Future  (p. 658) | html | pdf |
    • References | html | pdf |